Wichtige wissenschaftliche Partner sind die nationalen und internationalen Fachgesellschaften. Der Fraunhofer-Verbund IUK-Technologie hat drei der letzten vier Präsident*innen der Gesellschaft für Informatik gestellt und beherbergt seit 2013 darüber hinaus in seinen Berliner Geschäftsräumen das Hauptstadtbüro der Gesellschaft. Hieraus ergeben sich zahlreiche gemeinsame Initiativen, die von der langjährigen gemeinsamen Trägerschaft der Bundesweiten Informatikwettbewerbe über die Mitorganisation von vier Wissenschaftsjahren bis zur gemeinsamen Ansprache der Politik reichen. Mehrere Fraunhofer-Institutsleiter*innen wurden überdies zu Fellows der Gesellschaft für Informatik, ihrer internationalen Schwestergesellschaft ACM und der IEEE gewählt.
Der Fraunhofer-Verbund IUK-Technologie ist Mitglied beim European Research Consortium for Informatics and Mathematics ERCIM. Der Zusammenschluss europäischer Forschungseinrichtungen auf den Gebieten Informations- und Kommunikationstechnologie und angewandte Mathematik ermöglicht Nachwuchswissenschaftler*innen Stipendien bei führenden europäischen Forschungsinstituten. Die Themengebiete umfassen Computerwissenschaften, Informationstechnologie und angewandte Mathematik.
Der Fraunhofer-Verbund IUK-Technologie engagiert sich im BMBF-geförderten Entwicklungsprogramm für Führungskräfte Software-Campus des EIT ICT Labs Germany. Die Initiative vereint Spitzenforschung und Managementpraxis auf neuartige Weise. Absolvierende managen den gesamten Prozess von IT-Projekten mit Unterstützung von Forschungs- und Industriepartnern. Die Teilnehmenden werden in Form von Führungskräftetrainings, Mentorings, einer Praxisphase und aktiven Netzwerken unterstützt. Bisher konnten schon 18 Doktorand*innen aus Fraunhofer IUK-Verbundinstituten eigene Projekte in Zusammenarbeit mit der Industrie realisieren.